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        祝賀!天昊客戶微生物擴增子項目成功登陸環境工程和食品科學一區雜志


        原創 上海天昊生物 
         
        炎熱的夏季高溫漸退,可是天昊客戶發表文章的熱度卻持續高漲。最近,天昊客戶微生物16S擴增子項目文章又在環境工程食品科學一區雜志上連續發表,其中既有使用我們常規16S擴增子檢測的項目,又有利用天昊生物Accu16STM細菌絕對定量測序技術發表的文章。在恭喜客戶取得好成績的同時,也讓我們來看一下相關文章。

         

        01

         

        文章一

        1、英文題目:Response of microbial communities based on full-scale classification and antibiotic resistance genes to azithromycin and copper combined pollution in activated sludge nitrification laboratory mesocosms at low temperature
        中文題目:低溫下活性污泥硝化系統中基于全尺度分類的微生物群落和抗生素抗性基因對阿奇霉素和銅復合污染的響應
        期刊名:Bioresource Technology 
        影響因子:9.642  (工程技術類一區Top)
        發表時間:2021830


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        ◆研究概要:


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        自從抗生素的殺菌和抑菌功效被發現以來,抗生素的生產和使用量急劇增加。其中,大環內酯類、磺胺類、甲氧芐啶類和喹諾酮類在污水處理廠(WWTPs)的進出水中含量最為豐富,尤其是環境濃度相對較高的阿奇霉素(AZM)??股嘏cWWTPs中檢測到的抗生素抗性基因(ARGs)密切相關。ARGs被認為是新興基因型環境污染物,其傳播已成為新出現的公共衛生問題。此外,污水處理廠中大量存在的重金屬(如銅、鋅、鎳和鎘)導致了抗生素和重金屬的復合污染,進一步增加ARGs的豐度,并影響污水處理廠的處理性能。然而,抗生素和重金屬復合污染對污水處理廠處理性能和ARGs豐度增加的生態效應仍不清楚。
         
        本研究旨在探討低溫下活性污泥硝化系統中優勢/稀有菌屬和ARGsAZM (0.05-40 mg/L)和銅(1 mg/L)復合污染的短期響應。首先,作者研究了復合污染對硝化作用的抑制。在脅迫效應期,AZM劑量為四種濃度:環境濃度(E: 0.05 mg/L)、低濃度(L: 0.5 mg/L)、中濃度(M: 5 mg/L)和高濃度(H1: 20 mg/L,H2: 40 mg/L)。沒有AZM和銅的樣本為對照(Blank)。僅含環境濃度銅(1 mg/L)的樣本命名為Cu_E。其他含銅和AZM的樣品命名為AZM_E,AZM_L,AZM_M,AZM_H1AZM_H2。此外,探究了系統中撤銷AZM或銅的后效應期情況,相應的樣本命名為Blank_P,Cu_E_P,AZM_E_P,AZM_L_P,AZM_M_P,AZM_H1_PAZM_H2_P。通過不同周期進水和出水中氨氮、亞硝酸鹽、硝酸鹽和總氮濃度的變化,以及氨氮去除率的變化,發現在低溫條件下,隨著AZM濃度的增加,復合污染對硝化的抑制作用更加明顯,且高濃度下出現了一定的總氮去除,尤其是在AZM_H2 中高達48.72%。
         
        之后,利用天昊生物Accu16STM細菌絕對定量測序,檢測了樣本細菌16S rRNA基因的V3-V4區。分析了樣本中的細菌多樣性和群落結構的變化。在第六和第九個周期結束時收集活性污泥樣品,包括種子污泥(seed)在內總共收集15個混合活性污泥樣品。為了研究優勢菌群和稀有菌群對復合污染的響應,采用了一種全面的分類方法(全尺度分類),分為6個屬分類群,分別是AT、CAT、CRAT、MT、CRT、RT。應用PCA主成分分析法對6個分類群的群落結構進行了研究。結果發現AZM和銅的復合污染影響了脅迫和效應后時期的細菌多樣性和豐富度,AZM對這些分類群有不同的影響(圖1)。


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        1、微生物群落結構多樣性及主成分分析。

         

        根據全尺度分類,六個類群(AT、CAT、CRAT、MT、RTCRT) TOP屬的組成在不同AZM濃度的脅迫下表現出不同的響應及六類之間的交互關系在前后效應下也有所不同(圖2)。


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        2、脅迫效應和后效應期間的微生物群落組成和相互作用。

         
        最后,研究還發現稀有或優勢分類菌群(CRAT)是重要的類群。氨氧化古菌在氨氧化作用中扮演重要角色,3種好氧反硝化細菌(Brevundimonas、ComamonasTrichococcus)隨著AZM濃度增加有明顯富集現象(9.83%增加到68.91%)。根據預測分析,氨氮同化為有機氮和反硝化作用可能是去除氮的重要途徑。此外,29個被檢測出的ARGs亞型之間存在更多的共生模式,高濃度的AZM(大于5mg/L)可能會促進ARGs的增殖。更為重要的是,除了一些優勢菌群外,稀有菌群、潛在病原體和脫氮功能菌屬都是ARGs的主要潛在宿主。

         

         

        02

         

        文章二

        2、英文題目:Red Wine High-Molecular-Weight Polyphenolic Complex: An Emerging Modulator of Human Metabolic Disease Risk and Gut Microbiota
        中文題目:紅酒高分子量多酚復合物:人類代謝疾病風險和腸道微生物群的新興調節劑
        期刊名:Journal of Agricultural and Food Chemistry
        影響因子:5.272 (一區)
        發表時間:2021922

         

        ◆研究概要:

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        適量飲用紅酒與降低慢性疾病風險有關,還與腸道微生物群(GM)的有益調節有關。紅酒的這些潛在健康益處歸因于它的酚類成分,包括葡萄多酚,以及它們在釀酒過程中微生物轉化和/或陳釀過程中聚集產生的衍生物。迄今為止,人們對紅酒多酚的主要成分—高分子量多酚復合物(HPPCs)的物理化學性質和潛在生物效應知之甚少。本文研究了HPPCs在體外模擬胃腸條件下的穩定性和生化特性。
         
        本研究從紅酒中制備HPPCs和低聚多酚復合物(OPCs),體外模擬胃腸消化和結腸發酵分析。收集新鮮的人類糞便樣本,制成實驗糞便漿液。通過將糞便漿液與基礎營養培養基混合來制備人腸道微生物組液體(HGMF)。然后,將樣本分離后的樣本(HPPCs、OPCs或對照(去離子水))1:1的比例加入HGMF,并在37℃厭氧條件下培養24小時。在不同時間點(0、2、4、8、1224小時)收集樣本,收集沉淀物用于GM分析。
         
        結果表明,HPPCs對模擬胃消化(SGD)和模擬腸消化(SID)具有抗性。它們對代謝綜合征相關的關鍵消化酶顯示出顯著的抑制活性,在0.02-0.45 mg/mL時,對胰腺α-淀粉酶、脂肪酶和膽固醇酯酶的抑制率為17.1-90.9%,HPPCs處理后表現出抗氧化能力的顯著增強。
         
        之后,研究者利用常規擴增子測序技術,檢測了16S rRNA基因V3-V4區域,分析了樣本中的微生物多樣性情況,發現HPPCs處理后有利地調節了GM圖譜,這伴隨著結腸發酵早期短鏈脂肪酸生成的顯著增加。這些發現表明,HPPCs是一種有希望的人類代謝性疾病風險調節劑。


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        3、微生物組成的線性判別分析。


         

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        天昊生物微生物擴增子測序相關鏈接

        ●喜訊!天昊16S擴增子絕對定量測序項目文章登陸《Bioresource Technology》;

        ●又一篇!天昊Accu16S細菌絕對定量測序項目文章登陸國際頂級環境工程雜志《Bioresource Technology》;

        ●天昊16S擴增子絕對定量測序項目新文:金針菇β-型糖苷多糖對結腸炎小鼠的抗炎及腸道菌群調節作用;

        ●祝賀!天昊Accu16S細菌絕對定量測序項目登陸頂級環境雜志《Journal of Hazardous Materials》;

        ●又一篇!天昊客戶微生物16S擴增子測序再登頂級環境科學雜志《Journal of Hazardous Materials》;

        ●醫學、農學新應用,天昊Accu16S細菌絕對定量測序技術在骨質疏松和農業復墾領域收獲新文;

        ●向“真”而生!天昊生物AccuITS真菌絕對定量測序服務重磅上線;

        ●喜訊!天昊生物16S擴增子絕對定量測序項目文章再次登陸《Science of the Total Environment》;

        ●祝賀!天昊生物16S擴增子絕對定量測序技術助力客戶登陸Science of the Total Environment;

        ●又一篇!天昊生物微生物16S擴增子絕對定量測序技術再發好文;

        ●天昊微生物項目文章:水生高等植物凋落物分解過程中細菌與真菌之間的相互作用;

        ●【昊文章】天昊客戶細菌+真菌擴增子測序文章見刊《Frontiers in Microbiology》;

         

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