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        主頁 &amp;gt; 技術服務 &amp;gt; 動植物目的區域甲基化富集測序

        MethylTarget?多重目的區域甲基化富集測序

        MethylTarget?多重目的區域甲基化富集測序

        技術簡介:

        甲基化是一種非常重要的表觀遺傳學標記信息,參與了包括基因調控、生物發育、疾病發生等多種生物學過程,并且在大多數癌癥中廣泛發現甲基化異常。除了對于全基因組甲基化水平的觀察與研究,對于眾多目的基因的甲基化水平研究則更有針對性和大樣本可行性。使用亞硫酸氫鹽處理DNA后,天昊生物結合目的區域富集和二代測序技術,推出自主研發的多重目的區域甲基化富集測序技術——MethylTarget?,在大幅度降低研究費用的同時實現個性化目的區域甲基化測序。

        技術參數及分析內容


        技術優勢


           • 基于二代測序,可以獲得目的區域內所有C堿基的甲基化數據
           • 1000×的測序深度,精確計算每個位點C堿基的甲基化程度
           • 通量高,可同時對成百上千個區域進行甲基化程度分析
           • 適用于大樣本多區域的DNA甲基化水平檢測

        技術參數及分析內容


        技術路線



        生信分析



        客戶文章解讀

        1、Dietary betaine supplementation in hens modulates hypothalamic expression of cholesterol metabolic genes in F1 cockerels through modification of DNA methylation

        題目:母雞補充甜菜堿可以通過DNA甲基化修飾來調控F1代公雞下丘腦膽固醇代謝相關基因的表達

        合作單位:南京農業大學動物健康與食品安全國際合作聯合實驗室

        發表期刊:Comparative Biochemistry and Physiology

        發表時間:2018-3-2

        影響因子: 1.757


        文章簡介:

            甜菜堿廣泛應用于動物營養中,通過基因表達的調節進行營養重編程,促進蛋氨酸代謝過程中的生長、發育和甲基供體。據報道,產前甜菜堿暴露可調節雞的下丘腦膽固醇代謝,但尚不清楚飼喂添加甜菜堿的日糧是否會影響F1后代的下丘腦膽固醇代謝。在本研究中,研究者用基礎飼料或添加甜菜堿( 0.5 % )的飼料喂養母雞30天,收集蛋用于孵化。幼雛在同樣的條件下飼養到56天。甜菜堿處理組血漿總膽固醇和高密度脂蛋白膽固醇濃度顯著升高,下丘腦總膽固醇和膽固醇酯含量升高。同時,下丘腦SREBP2、HMGCR和LDLR基因表達顯著上調。SREBP1、ACAT1和APO-A1的基因豐度上調,CYP46A1的基因豐度顯著下調。這些變化與腦源性神經營養因子和促腎上腺皮質激素的顯著下調和NPY基因表達的顯著上調相一致。此外,參與甲基轉移循環的基因也受到調節。DNMT1和BHMT在基因和蛋白質水平均上調,這與硫酸氫鹽測序檢測到的SREBP-1、SREBP-2和APO-A1基因啟動子上CpG甲基化的顯著改變有關。這些結果表明,飼喂甜菜堿通過改變啟動子甲基化來調節F1小公雞膽固醇代謝和腦功能相關基因的下丘腦表達。


        圖1、SREBP1啟動子甲基化狀態


        2、Dietary betaine supplementation increases adrenal expression of steroidogenic acute regulatory protein and yolk deposition of corticosterone in laying hens

        題目:補充甜菜堿促進蛋雞類固醇激素合成急性調節蛋白和卵黃沉積腎上腺皮質酮的表達

        合作單位:南京農業大學動物生理生化重點實驗室

        發表期刊: Poultry Science

        發表時間:2017-12-1

        影響因子: 1.908


        文章簡介:

            甜菜堿是一種重要的甲基供體,已知它通過營養重編程對基因表達進行表觀遺傳調控。在本文中,研究者探討了飼喂添加甜菜堿的日糧是否會影響腎上腺皮質類固醇的生物合成和蛋中皮質酮的沉積,與甲基轉移酶的表達和受影響基因的啟動子脫氧核糖核酸甲基化狀態相關。將38周齡的如皋黃羽蛋雞分為對照組和甜菜堿組,分別飼喂基礎日糧和甜菜堿添加日糧,為期4周。甜菜堿的添加顯著提高了平均產蛋率,而體重和蛋品質保持不變。甜菜堿組血漿膽固醇和低密度脂蛋白膽固醇濃度也較高。此外,甜菜堿組雞蛋蛋黃中含有較高的皮質酮,這與腎上腺類固醇生成基因的上調有關。類固醇生成急性調節蛋白( StAR ),負責將膽固醇轉運到線粒體內膜的限速蛋白,與其轉錄因子類固醇生成因子-1 (SF-1 )和糖皮質激素受體一起被顯著激活。此外,補充甜菜堿顯著上調腎上腺腺苷同型半胱氨酸酶樣1和脫氧核糖核酸甲基轉移酶1和3a的表達。亞硫酸氫鹽測序分析顯示腎上腺中SF-1基因啟動子區的幾個CpG位點存在顯著的低甲基化。這些結果表明,日糧中添加甜菜堿可能通過SF-1基因的表觀遺傳調節激活腎上腺StAR的表達。


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