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        主頁 &amp;gt; 技術服務 &amp;gt; 腫瘤目標區域芯片捕獲測序

        腫瘤目的區域捕獲測序

        腫瘤目的區域捕獲測序

        技術簡介:

        腫瘤目的區域捕獲測序是指通過對感興趣的腫瘤目的基因進行富集后測序,為癌癥研究提供了經濟、省時、高效的研究策略。目前天昊生物提供兩種目的區域捕獲策略,基于多重PCR的FastTargetTM多重目的區域富集測序,和基于液相雜交的目的區域定制芯片捕獲測序。
            FastTargetTM技術針對目的區域設計多重PCR擴增體系,對研究者感興趣的基因組區域進行捕獲富集。一個擴增反應體系可以完成16-20個PCR反應,直接獲得4kb左右的基因組區域。該技術方法非常成熟,方法快速、操作簡單,無需復雜的建庫過程。后續,利用Illumina Hiseq測序儀的2×150bp測序模式對目的片段實現雙向測序,對所獲得測序數據進行生物信息學的讀取、質控及分析,研究感興趣的序列及序列差異。該方法非常適合< 200kb的多個候選基因外顯子或連續區域富集二代測序項目。
            定制芯片富集方法利用商業Agilent SureSelect液相芯片富集捕獲系統,定制目的區域的相關捕獲探針,通過探針與樣品片段化DNA的雜交和富集,將捕獲之后洗滌獲得的目的區域片段進行文庫構建,擴增后利用Illumina Hiseq 高通量二代測序系統進行PE150的測序,對所獲得測序數據進行生物信息學的讀取、質控及分析,研究感興趣的序列及序列差異。該方法非常適合100kb-12Mb區域的多個候選基因外顯子或連續區域富集二代測序項目。


        技術參數及分析內容


        技術優勢


           • 目的區域測序花費更小、效率更高
           • 針對性更強,結果更容易解釋
           • 可以實現更深的測序深度,更容易發現罕見變異

        技術參數及分析內容




        技術路線



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