• <code id="6xtkq"><small id="6xtkq"></small></code>
    <center id="6xtkq"><em id="6xtkq"><track id="6xtkq"></track></em></center>
    1. <th id="6xtkq"></th>
      <center id="6xtkq"><small id="6xtkq"></small></center>
      <tr id="6xtkq"></tr>
      <code id="6xtkq"></code>

    2. <code id="6xtkq"></code>
      <code id="6xtkq"><em id="6xtkq"><track id="6xtkq"></track></em></code>

        咨詢熱線:400-065-6886   天昊基因

        中文 / English

        主頁 &amp;gt; 技術服務 &amp;gt; 宏基因組測序

        宏基因組測序

        宏基因組測序

        技術簡介:

            宏基因組(metagenome)是指特定環境中全部生物(微生物)遺傳物質DNA的總和。宏基因組測序研究就是對一個環境樣品內所有微生物DNA進行測序,然后將測序序列與已知物種序列數據庫進行比對,從而能夠獲得樣本微生物的群落結構組成;同時進行序列拼接組裝、基因預測,從而了解該環境樣本中微生物的功能基因,進而分析差異基因和差異功能等??偟膩碚f,宏基因組關注三個最核心的問題:菌落結構;功能基因;功能通路。

        技術優勢:

           • 宏基因組比微生物個體研究更能反映微生物生存的真實狀態。
           • 宏基因組測序直接對環境中所有的微生物進行測序。
           • 使用高通量測序,能夠獲得低豐度物種的功能信息。
           • 構建不同物種之間協同的代謝網絡。

        技術參數與實驗流程


        技術參數



        試驗流程


        B. 數據分析流程




        經典案例解讀

        案例:斷奶推動人類嬰兒腸道微生物組成熟

        背景:

            腸道微生物菌群和人類健康息息相關。但新生兒腸道微生物菌群的確立過程始終沒有被系統的研究。本研究通過新生兒一年生長期的腸道微生物菌群宏基因組研究,探討了新生兒腸道菌群變化,同時分析了生產方式和哺育方式對新生兒腸道菌群的影響。

        方法:

            研究人員收集了瑞典98名母親及其新生兒的糞便樣本,然后在這些嬰兒4個月和12個月的時候再次收集糞便樣本,通過Illumina Hiseq平臺宏基因組鳥槍測序技術測定腸道微生物的組成和功能基因。新生兒包括母乳喂養和非母乳喂養組別,順產和破腹產組別。

        結果:

           • 通過宏基因組測序(Hiseq2000,2 × 100bp),共獲得1.52Tb reads,每個樣本獲得39.9million reads。鑒定了4,356個新細菌基因組。
           • 剖腹產嬰兒的腸道菌群與順產嬰兒差異顯著。剖腹產嬰兒的腸道菌群含有許多口腔和皮膚菌,而順產嬰兒與母親腸道菌群更為相近。
           • 正常嬰兒的腸道菌群會隨著飲食改變而逐步成熟,直到嬰兒斷奶之后,固體食物才會顯著促進微生物組的多糖降解能力。即斷奶會推動人類嬰兒腸道微生物組成熟。

        參考文獻:

            Backhed, F., et al., Dynamics and Stabilization of the Human Gut Microbiome during the First Year of Life. Cell Host Microbe, 2015. 17(5): p. 690-703.

        圖一:本研究的摘要

        圖二:基于625個META-OTU繪制母親、新生兒不同生長期腸道微生物菌群進化樹


        上海天昊生物科技有限公司 版權所有 滬ICP備17008908號
        地址:上海市浦東新區康橋路787號9號樓 郵箱:techsupport@geneskies.com 電話:400-065-6886
        国产交换配乱婬视频偷,日本高清免费一本视频在线观看,米奇影院888奇米色99在线,久久超碰极品视觉盛宴