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        主頁 &amp;gt; 技術服務 &amp;gt; SNPseq?超高通量SNP分型技術

        SNPseq?超高通量SNP分型技術

        SNPseq?超高通量SNP分型技術

        技術簡介:

               適用于針對大通量SNP位點的分型項目,至少1000個以上樣本、300至數千個以上的SNP位點;對絕大多數SNP位點都具有很好的分型效果。

        SNPseq?超高通量SNP分型技術是由上海天昊生物科技有限公司自主專利開發的多重SNP分型專利技術。

        技術原理:


              SNPseq?超高通量SNP分型技術是由上海天昊生物科技有限公司自主專利開發的多重SNP分型專利技術。該技術能在一個檢測流程中同時實現300至數千個SNP位點進行分型。該技術基本原理是采用多重PCR對包含有待分型SNP位點的DNA區段富集,通過通用引物PCR擴增構建二代測序上樣文庫,最后通過Illumina? Hiseq高通量測序(500~1000X),結合二代測序數據分析獲取各個SNP位點的基因型。

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        高效快速:

               每個反應可以實現數千個SNP位點分型檢測,同時可將上千個樣本標記混在一起檢測,1臺Illumina? Hiseq2500可以在3天之內完成800萬個分型 ,而常規芯片只能單個或數個樣本同時檢測。

        操作簡單:

               1個連接反應,1個PCR反應,1次純化即可上機器,而常規芯片分型檢測操作繁瑣。

        成本低廉:

               同目前的SNP定制芯片相比,我們可以自行設計探針體系與試劑,基于二代測序技術分型,單個SNP分型成本很低。

        準確性高:

              由于連接酶識別特異性高,且非特異性連接產物可通過測序數據分析排除,大大提高數據準確性。

        技術參數:

             • SNP數量:300-數千
             • 樣品數量:> 1000個
             • 位點成功率:>95%
             • Call rate:>98%
             • 準確性:>99.8%

        檢測實例:

        測序分型數據:

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