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        主頁 &amp;gt; 技術服務 &amp;gt; 腫瘤泛癌種基因panel突變檢測

        腫瘤泛癌種基因panel突變檢測

        腫瘤泛癌種基因panel突變檢測

        技術簡介:

        腫瘤多數因體細胞突變(Somatic Mutation)積累引起,相較于常規樣本中生殖突變(Germline Mutation)位點的檢測,腫瘤樣本因為純度低、異質性高、質量差等原因,需要更高的測序深度、更優化的數據分析方法才能更有效、更精確地鑒定其中的突變位點。
            芯片捕獲測序(Target Capture Sequencing)基于核酸雜交技術,是一種使用探針將目標區域的DNA捕獲富集后進行高通量測序的實驗方法,可針對性極強地鑒定特定區域的遺傳變異或遺傳多態。相較于全基因組測序(Whole Genome Sequencing,WGS)以及全外顯子組測序(Whole Exome Sequencing,WES),芯片捕獲測序在相同測序成本條件下,可對目標區域進行更高深度地檢測,這使得鑒定高度異質性腫瘤樣品中的低頻突變成為可能。
            基于美國食藥監局(FDA)批準的用于腫瘤基因檢測的FoundationOne CDxTM與MSK-IMPACTTM,天昊生物精心設計合成了安捷倫SureSelectTM探針,涵蓋529個候選腫瘤基因的全部外顯子(exons)及部分非翻譯區(UTR),這些基因包括腫瘤高頻突變、腫瘤易感、藥物靶向、藥物耐受等多種類型基因。配套業界公認的安捷倫SureSelect捕獲平臺,該腫瘤基因芯片檢測體系能夠實現SNV、Indel、CNV、Gene Arrangement、SV、MSI、TMB等多種突變類型的檢測。兼容實體瘤、石蠟切片、血漿等多種類型樣品,以滿足腫瘤相關的科研實驗、臨床檢測的多方面需求??蛻粢部梢赃x擇定制芯片探針,從而更加契合自己的實驗需求。
            天昊生物使用全自動核酸抽提工作站,確保樣本抽提的穩定性,最大程度避免樣本間污染。使用業內最優的Covaris超聲基因組片段化方案,結合精心優化的文庫構建體系進行DNA文庫構建,最大程度地保證文庫轉化效率。在滿足高深度測序的同時,盡可能減少珍貴實驗樣本的消耗,多重保障確保腫瘤樣本體細胞突變檢出的靈敏度和特異性。


        技術參數及分析內容


        技術優勢


           • 金標準:使用業界公認的SureSelect捕獲
           • 精準檢測:芯片設計基于FDA認證的兩大檢測體系,涵蓋主流的腫瘤基因
           • 高性價比:相較全外顯子組測序,相同測序量可高深度地檢測更多實驗樣品

        技術參數及分析內容


        技術路線



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